간만에 황우석씨에 대한 글을 써 봅니다. 이 글에서는 Cell의 휘하지 Cell Stem Cell에 short article로 8월 2일자로 실린 논문, Recombination Signatures Distinguish Embryonic Stem Cells Derived by Parthenogenesis and Somatic Cell Nuclear Transfer (recombination signature를 이용하여 배아줄기세포가 단성생식에서 유래했는지 체세포핵치환에서 유래했는지를 판별하다) 에 대한 이야기를 해 볼까 합니다. 본 논문의 제일저자는 Children's Hospital Boston and Dana-Farber Cancer Institute와 Harvard 의대에 계신 김기태(Kitai Kim)씨이며 교신저자는 George Q. Daley씨입니다.

SUMMARY
Parthenogenesis and somatic cell nuclear transfer (SCNT) are two methods for deriving embryonic stem (ES) cells that are genetically matched to the oocyte donor or somatic cell donor, respectively. Using genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) analysis, we demonstrate distinct signatures of genetic recombination that distinguish parthenogenetic ES cells from those generated by SCNT. We applied SNP analysis to the human ES cell line SCNT-hES-1, previously claimed to have been derived by SCNT, and present evidence that it represents a human parthenogenetic ES cell line. Genome-wide SNP analysis represents a means to validate the genetic provenance of an ES cell line.
단성생식과 체세포핵치환(SCNT)은 배아줄기세포(ES cell)를 만들 수 있는 방법이며 이렇게 만들어진 줄기세포는 유전적으로 난자 기증자(oocyte donor; 역자 주 : 정확히 말하면 oocyte는 난자가 아니지만 대충 그 정도로 생각해 주시면 됩니다)나 체세포 기증자 둘 중 하나의 것과 일치하게 된다. 우리는 유전체 전반에 걸친 단일 뉴클레오타이드 다형성(single nucleotide polymorphism; SNP) 분석 실험을 수행하였고, 그 실험을 통하여 유전적 재조합(genetic recombination)의 형상이 두 경우에 서로 달라서 이를 통해 단성생식 배아줄기세포와 체세포핵치환 배아줄기세포를 구별할 수 있다는 사실을 보여주었다. 우리는 예전 논문에서 SCNT에 의해 만들어졌다고 했던 인간 줄기세포주인 SCNT-hES-1을 제공받아 SNP 분석 실험을 행하였으며, 이를 통해 SCNT-hES-1이 인간의 단성생식을 통해 만들어진 줄기세포주라는 것을 증명하였다. 이와 같이 유전체 전반에 걸친 SNP 분석 실험은 배아줄기세포주의 유전적 유래를 검증할 수 있는 방법으로 이용될 수 있다.

즉 논문 자체는 매우 간단합니다. 논문의 introduction 부분에서는 배아줄기세포가 여러 방법을 통해 만들어질 수 있음을 이야기하고 있으며 또한 황우석씨가 만들어서 발표한 것이 SCNT를 통해서 만들어진 줄기세포였다, 하지만 그것이 거짓으로 밝혀졌다 같은 이야기를 하고 있습니다. 또한 최근 연구에 의해 설치류의 배아줄기세포를 가지고 SNP라는 방법으로 찍어본 결과 이게 어디서 유래했는지를 알 수 있게 되었다. 즉 mouse와 같은 설치류에서는 SNP를 이용해 단성생식으로 형성된 것이냐, 다른 방법으로 형성된 줄기세포냐 하는 것을 알게 되었다는 이야기입니다. 그리고 result로 가면 실제 mouse에서와 SCNT-hES-1의 연구 결과를 보여 줍니다.

이 논문에서의 실험을 통하여, 서울대 조사위원회에서 단성생식으로 추정했던 결과는 실험적인 증거까지 얻게 된 셈입니다. 만일 황우석씨가 애초에 SCNT-hES-1을 단성생식으로 파악하고, 어떻게 이것을 형성했는지 하는 연구를 열심히 했더라면 지금과 같은 결과가 나오지 않았을 수도 있습니다. 참고로, 단성생식으로 만들어진 줄기세포의 경우에는 체세포 핵치환으로 만들어진 줄기세포를 선전해대던 것과는 달리 어떤 엄청난 기적(?) 같은 것은 주지 못할지 몰라도, 생물학적인 실험 등에 큰 효용이 있습니다. 때문에 단성생식 줄기세포를 만들어 내는 것도 분명 의미가 있는 연구입니다. 그렇기 때문에 황우석씨가 마음을 잘못 먹지 않았으면... 하는 아쉬움은 남지만 지난 일은 어쩔 수 없는 것이죠.